Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RykQ01887 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RykQ01887 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RykQ01887 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RykQ01887 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RykQ01887 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RykQ01887 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RykQ01887 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RykQ01887 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RykQ01887 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RykQ01887 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RykQ01887 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RykQ01887 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RykQ01887 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RykQ01887 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RykQ01887 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RykQ01887 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RykQ01887 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RykQ01887 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RykQ01887 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RykQ01887 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RykQ01887 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RykQ01887 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RykQ01887 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RykQ01887 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RykQ01887 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RykQ01887 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RykQ01887 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RykQ01887 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RykQ01887 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RykQ01887 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RykQ01887 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RykQ01887 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RykQ01887 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RykQ01887 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RykQ01887 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RykQ01887 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RykQ01887 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RykQ01887 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RykQ01887 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RykQ01887 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RykQ01887 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RykQ01887 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RykQ01887 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RykQ01887 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RykQ01887 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms