Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
VcpQ01853 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VcpQ01853 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VcpQ01853 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VcpQ01853 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VcpQ01853 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms