Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd1Q01822 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd1Q01822 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms