Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nme2Q01768 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nme2Q01768 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms