Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gbp1Q01514 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gbp1Q01514 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms