Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Top2aQ01320 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Top2aQ01320 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Top2aQ01320 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms