Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PrcdQ00LT2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms