Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeleQ00690 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeleQ00690 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeleQ00690 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SeleQ00690 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms