Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga4Q00651 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Itga4Q00651 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms