Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Il6stQ00560 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Il6stQ00560 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Il6stQ00560 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms