Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tcf7Q00417 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tcf7Q00417 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms