Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PgrQ00175 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PgrQ00175 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PgrQ00175 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PgrQ00175 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PgrQ00175 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms