Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rbbp6P97868 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rbbp6P97868 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms