Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AlkP97793 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AlkP97793 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AlkP97793 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AlkP97793 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AlkP97793 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AlkP97793 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AlkP97793 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AlkP97793 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AlkP97793 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AlkP97793 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AlkP97793 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AlkP97793 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AlkP97793 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AlkP97793 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AlkP97793 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AlkP97793 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AlkP97793 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AlkP97793 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AlkP97793 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AlkP97793 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AlkP97793 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AlkP97793 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AlkP97793 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AlkP97793 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AlkP97793 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AlkP97793 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AlkP97793 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AlkP97793 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AlkP97793 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AlkP97793 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AlkP97793 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AlkP97793 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AlkP97793 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AlkP97793 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AlkP97793 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AlkP97793 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AlkP97793 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AlkP97793 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AlkP97793 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AlkP97793 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AlkP97793 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AlkP97793 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AlkP97793 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AlkP97793 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AlkP97793 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AlkP97793 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AlkP97793 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
AlkP97793 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AlkP97793 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
AlkP97793 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AlkP97793 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AlkP97793 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AlkP97793 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AlkP97793 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AlkP97793 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AlkP97793 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AlkP97793 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AlkP97793 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AlkP97793 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AlkP97793 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AlkP97793 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AlkP97793 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AlkP97793 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AlkP97793 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AlkP97793 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AlkP97793 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AlkP97793 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AlkP97793 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AlkP97793 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AlkP97793 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AlkP97793 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AlkP97793 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AlkP97793 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AlkP97793 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AlkP97793 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AlkP97793 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AlkP97793 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
AlkP97793 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms