Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Smarcc1P97496 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smarcc1P97496 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smarcc1P97496 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms