Protein–RNA interactions for Protein: P97470

Ppp4c, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4cP97470 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppp4cP97470 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp4cP97470 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms