Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas1P97459 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Npas1P97459 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas1P97459 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Npas1P97459 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms