Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nbr1P97432 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nbr1P97432 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nbr1P97432 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms