Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LystP97412 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LystP97412 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LystP97412 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LystP97412 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LystP97412 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LystP97412 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LystP97412 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LystP97412 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LystP97412 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LystP97412 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LystP97412 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LystP97412 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LystP97412 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LystP97412 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LystP97412 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LystP97412 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LystP97412 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LystP97412 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LystP97412 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms