Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mesp1P97309 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp1P97309 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms