Protein–RNA interactions for Protein: P86792

Ccl21b, C-C motif chemokine 21b, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21bP86792 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl21bP86792 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl21bP86792 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms