Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Arf1P84078 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arf1P84078 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arf1P84078 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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