Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rad50P70388 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad50P70388 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad50P70388 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rad50P70388 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rad50P70388 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rad50P70388 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rad50P70388 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms