Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sema3eP70275 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sema3eP70275 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sema3eP70275 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms