Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pdlim4P70271 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pdlim4P70271 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms