Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad54lP70270 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rad54lP70270 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rad54lP70270 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms