Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf5P70191 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf5P70191 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf5P70191 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Traf5P70191 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf5P70191 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Traf5P70191 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms