Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbdsP70122 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbdsP70122 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SbdsP70122 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbdsP70122 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbdsP70122 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms