Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crip1P63254 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Crip1P63254 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Crip1P63254 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Crip1P63254 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms