Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrx1P63013 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prrx1P63013 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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