Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Uba52P62984 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Uba52P62984 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms