Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rps18P62270 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rps18P62270 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms