Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmo4P61969 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmo4P61969 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms