Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Copz1P61924 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Copz1P61924 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms