Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf13P61216 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Taf13P61216 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf13P61216 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms