Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nup43P59235 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nup43P59235 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nup43P59235 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup43P59235 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nup43P59235 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nup43P59235 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup43P59235 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms