Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scarf2P59222 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scarf2P59222 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scarf2P59222 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scarf2P59222 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scarf2P59222 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scarf2P59222 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scarf2P59222 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms