Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcif1P59114 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcif1P59114 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcif1P59114 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms