Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Senp1P59110 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Senp1P59110 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Senp1P59110 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Senp1P59110 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Senp1P59110 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Senp1P59110 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Senp1P59110 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Senp1P59110 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms