Protein–RNA interactions for Protein: P58462

Foxp1, Forkhead box protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp1P58462 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxp1P58462 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxp1P58462 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxp1P58462 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxp1P58462 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxp1P58462 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms