Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn4P58404 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strn4P58404 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Strn4P58404 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strn4P58404 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Strn4P58404 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Strn4P58404 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Strn4P58404 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Strn4P58404 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Strn4P58404 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Strn4P58404 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Strn4P58404 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Strn4P58404 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms