Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snrpa1P57784 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Snrpa1P57784 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms