Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd38P56528 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd38P56528 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms