Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckbrP56481 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckbrP56481 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CckbrP56481 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CckbrP56481 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CckbrP56481 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms