Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irf5P56477 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf5P56477 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf5P56477 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf5P56477 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf5P56477 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irf5P56477 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms