Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1bbP56400 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1bbP56400 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms