Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GemP55041 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GemP55041 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GemP55041 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GemP55041 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GemP55041 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GemP55041 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GemP55041 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GemP55041 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GemP55041 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GemP55041 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GemP55041 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GemP55041 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GemP55041 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GemP55041 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GemP55041 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GemP55041 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GemP55041 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GemP55041 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GemP55041 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GemP55041 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GemP55041 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GemP55041 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GemP55041 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GemP55041 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GemP55041 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GemP55041 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GemP55041 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GemP55041 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GemP55041 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GemP55041 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GemP55041 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GemP55041 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GemP55041 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GemP55041 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GemP55041 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GemP55041 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GemP55041 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GemP55041 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms