Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rad23bP54728 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad23bP54728 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad23bP54728 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms