Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb3P54285 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cacnb3P54285 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb3P54285 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms