Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Map3k1P53349 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Map3k1P53349 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Map3k1P53349 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Map3k1P53349 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms